Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms