Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms