Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms