Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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SPIDRQ14159 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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SPIDRQ14159 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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SPIDRQ14159 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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SPIDRQ14159 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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SPIDRQ14159 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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SPIDRQ14159 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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