Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms