Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
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