Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCGB2A2Q13296 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SCGB2A2Q13296 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCGB2A2Q13296 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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