Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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SRSF6Q13247 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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SRSF6Q13247 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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SRSF6Q13247 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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SRSF6Q13247 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SRSF6Q13247 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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