Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPAL4Q0D2K0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms