Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD47Q08722 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms