Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms