Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms