Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms