Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAT1AQ00266 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms