Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms