Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP1P63208 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SKP1P63208 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SKP1P63208 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SKP1P63208 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP1P63208 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP1P63208 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP1P63208 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP1P63208 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP1P63208 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP1P63208 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP1P63208 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP1P63208 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP1P63208 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP1P63208 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP1P63208 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP1P63208 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP1P63208 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP1P63208 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP1P63208 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP1P63208 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP1P63208 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms