Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms