Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPCS3P61009 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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