Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms