Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA9P57773 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA9P57773 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJA9P57773 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJA9P57773 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJA9P57773 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJA9P57773 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJA9P57773 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJA9P57773 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJA9P57773 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJA9P57773 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJA9P57773 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms