Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCR5P51681 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCR5P51681 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCR5P51681 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCR5P51681 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCR5P51681 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCR5P51681 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCR5P51681 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCR5P51681 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCR5P51681 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCR5P51681 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCR5P51681 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCR5P51681 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR5P51681 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR5P51681 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR5P51681 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR5P51681 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR5P51681 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR5P51681 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR5P51681 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR5P51681 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR5P51681 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR5P51681 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR5P51681 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR5P51681 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR5P51681 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR5P51681 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR5P51681 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR5P51681 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR5P51681 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR5P51681 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR5P51681 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR5P51681 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR5P51681 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms