Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms