Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGP37231 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGP37231 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PPARGP37231 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PPARGP37231 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PPARGP37231 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PPARGP37231 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PPARGP37231 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PPARGP37231 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PPARGP37231 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PPARGP37231 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PPARGP37231 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PPARGP37231 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms