Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBRP36941 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LTBRP36941 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LTBRP36941 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LTBRP36941 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LTBRP36941 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms