Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7BP35670 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7BP35670 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7BP35670 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7BP35670 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7BP35670 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7BP35670 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7BP35670 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7BP35670 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7BP35670 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7BP35670 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7BP35670 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7BP35670 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7BP35670 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7BP35670 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7BP35670 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7BP35670 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7BP35670 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7BP35670 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7BP35670 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7BP35670 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms