Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPC1P35052 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms