Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH4A1P30038 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms