Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCAP28676 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms