Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX2P28328 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms