Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms