Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PLNP26678 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PLNP26678 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PLNP26678 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PLNP26678 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PLNP26678 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PLNP26678 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PLNP26678 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PLNP26678 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PLNP26678 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PLNP26678 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PLNP26678 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
PLNP26678 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PLNP26678 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PLNP26678 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms