Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MYF6P23409 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYF6P23409 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYF6P23409 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYF6P23409 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYF6P23409 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYF6P23409 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms