Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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