Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms