Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms