Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSLP07711 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSLP07711 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms