Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CYTIPO60759 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CYTIPO60759 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CYTIPO60759 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CYTIPO60759 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CYTIPO60759 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CYTIPO60759 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYTIPO60759 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYTIPO60759 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYTIPO60759 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYTIPO60759 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYTIPO60759 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYTIPO60759 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYTIPO60759 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYTIPO60759 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CYTIPO60759 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CYTIPO60759 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYTIPO60759 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYTIPO60759 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYTIPO60759 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYTIPO60759 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYTIPO60759 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYTIPO60759 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYTIPO60759 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYTIPO60759 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CYTIPO60759 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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