Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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SIAH2O43255 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SIAH2O43255 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SIAH2O43255 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SIAH2O43255 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SIAH2O43255 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SIAH2O43255 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SIAH2O43255 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIAH2O43255 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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