Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
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