Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms