Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms