Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL33A6NCF5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL33A6NCF5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms