Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms