Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms