Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USH1CQ9Y6N9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USH1CQ9Y6N9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms