Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms