Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B4

SF3B6, Splicing factor 3B subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6Q9Y3B4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SF3B6Q9Y3B4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SF3B6Q9Y3B4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SF3B6Q9Y3B4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SF3B6Q9Y3B4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF3B6Q9Y3B4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF3B6Q9Y3B4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF3B6Q9Y3B4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF3B6Q9Y3B4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF3B6Q9Y3B4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF3B6Q9Y3B4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF3B6Q9Y3B4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SF3B6Q9Y3B4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SF3B6Q9Y3B4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms