Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EPDR1Q9UM22 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPDR1Q9UM22 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPDR1Q9UM22 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPDR1Q9UM22 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPDR1Q9UM22 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPDR1Q9UM22 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPDR1Q9UM22 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPDR1Q9UM22 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPDR1Q9UM22 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPDR1Q9UM22 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPDR1Q9UM22 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms