Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MBD1Q9UIS9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD1Q9UIS9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms