Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CNTNAP2Q9UHC6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTNAP2Q9UHC6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms